将高通量表型工具应用于马铃薯:初步结果与经验总结


发布时间:

2024-06-21

来源:

作者:

本研究旨在提供将ALPHI®表型工具转移至马铃薯上的初步结果和经验。ALPHI®设备是一种配备有RGB相机和光谱辐射计的拖拉机,能够在微型试验地中获取近距离传感变量。该设备最初是为谷物开发的,将其应用于马铃薯是INNO-VEG项目的目标之一。基于两次田间试验,比较了五种马铃薯品种在两种氮肥施用水平下的产量和氮吸收量,研究结果表明,ALPHI®工具具有以下能力:(1) 实际操作于马铃薯微型试验地;(2) 提供已知对其他作物有用的一系列近距离传感变量(由RGB相机计算的绿色分数和植被指数CIgreen、CIrededge、MTCI、MCARI2和NDVI)。对结果的初步分析表明,这些近距离传感变量与先前研究的结果一致,无论是在时间跨度上与植物覆盖动态的总体模式,还是在与生物量积累、氮含量、氮吸收和产量相关的农艺变量之间的关系上。进一步的研究已经计划中,以通过其他数据源加强结果。ALPHI®工具也将不断优化,朝着更加实用的设备发展,并包括更复杂和更具信息量的近距离传感变量。

 

图1 在马铃薯实验中使用ALPHI®高通量表型工具

 

图2 计算近距离传感变量的方法:a. 通过RGB图像计算获取绿色分数(GF);b. 由光谱辐射计获取的光谱示例;c. 使用AUC方法分析GF动态变化;d. 使用AUC方法分析一种植被指数(CIrededge)的动态变化。

 

图3 月累计降雨量、最低气温、平均气温和最高气温在TRIAL.2020(左侧)和TRIAL.2021(右侧)生长周期中的变化。

 

图4 在重复试验尺度上,农艺变量与传感器变量(绿色分数GF、CIgreen和CIrededge)之间的关系。下方部分显示了成对比较的回归线,对角线显示了每个变量的分布,上方部分显示了成对比较的Pearson相关系数(涵盖两个试验以及各个单独试验)。传感器变量的值来自AUC方法。QNhau = 茎秆氮吸收量(kg N ha−1);QNtub = 块茎氮吸收量(kg N ha−1);QNtot = 整株植物(茎秆+块茎)氮吸收量(kg N ha−1);NNI = 氮营养指数。

 

图5 在重复试验尺度上,农艺变量与传感器变量(MCARI2、MTCI和NDVI)之间的关系。下方部分显示了成对比较的回归线,对角线显示了每个变量的分布,上方部分显示了成对比较的Pearson相关系数(涵盖两个试验以及各个单独试验)。传感器变量的值来自AUC方法。QNhau = 茎秆氮吸收量(kg N ha−1);QNtub = 块茎氮吸收量(kg N ha−1);QNtot = 整株植物(茎秆+块茎)氮吸收量(kg N ha−1);NNI = 氮营养指数。

 

图6 根据处理情况,从种植开始到热时间的传感器变量动态。左侧为TRIAL.2020的数据,右侧为TRIAL.2021的数据。a, b 绿色分数(GF);c, d CIgreen;e, f CIrededge。为清晰起见,每个日期每次测量的标准差未显示。处理的图例在d中显示。

 

图7 根据处理情况,从种植开始到热时间的传感器变量动态。左侧为TRIAL.2020的数据,右侧为TRIAL.2021的数据。a, b MTCI;c, d MCARI2;e, f NDVI。为清晰起见,每个日期每次测量的标准差未显示。处理的图例在d中显示。

 

来 源

Degan F, Fournier A, Gierczak F, et al. Adapting the High-Throughput Phenotyping Tool ALPHI® to Potatoes: First Results and Lessons[J]. Potato Research, 2024: 1-21.

https://doi.org/10.1007/s11540-024-09729-w

 

编辑

小王博士在努力

推荐新闻

石时之约|韩志国:透过表型数据,看见植物的喜怒哀乐!

本期石时之约,我们将对话江南平台app体育总经理、国际植物表型学会(IPPN)执委会委员/工业分会副主席韩志国,一起从表型数据的科学角度,去读懂农作物的喜怒哀乐和前世今生。

慧科研、慧育种、慧种田——慧聚改变的力量

让我们“慧聚”在一起,为“慧科研、慧育种、慧种田”赋能。

高通量植物表型平台建设注意事项

育种,是在给定的环境条件下,选择各种表型指标(产量、品质、抗性)最优的基因型材料的过程(AI育种,从这里起步)。育种工作中大约70%的工作量来自表型观察测量和筛选,是最耗人力物力的过程。

作物生理表型测量基础原理

生理表型测量的核心在于“早、快”,要在肉眼可见之前就能测量并预判出变化趋势,才是这个技术的核心价值。叶绿素荧光成像,恰好满足了这个要求。